Attualmente ha due sedi: quella di Magliano Sabina e quella di Poggio Mirteto. La sezione di Magliano è custodita all’interno dell’ex palazzo episcopale in Piazza Duomo e all’interno della Concattedrale di San Liberatore. È composto principalmente da tre fondi: il fondo vescovile della Diocesi di Sabina, il fondo storico del capitolo della Cattedrale di Magliano e quello di alcune confraternite. La sezione di Poggio Mirteto è conservata all’interno dell’attuale palazzo vescovile: è composta da molteplici serie archivistiche eterogenee, formatesi per sommatoria di documenti ecclesiastici diversi. Al suo interno sono conservati gli archivi del Governatorato dell’Abbazia di Farfa, nullius diocesis fino al 1841, che aveva sede dalla metà del XV secolo a Poggio Mirteto. Altri fondi custoditi sono: il fondo della Parrocchia Cattedrale di Santa Maria Assunta in Poggio Mirteto, il fondo di numerose confraternite e i fondi delle Parrocchie delle diocesi. L’Archivio Storico conta approssimativamente 4600 unità archivistiche, tra fascicoli, registri e volumi in circa 2000 unità conservative, databili dal primo decennio del XVI secolo al 1945.
